Летопись войн в школе Мурё

Семнадцатилетний Шиничи Кудо обладает развитыми аналитическими способностями, за что получил прозвище "современный Шерлок". После встречи с подругой детства Ран он становится свидетелем преступления, совершаемого членами мафиозной группировки. Преступники замечают юношу, захватывают его и принудительно дают ему принять экспериментальную таблетку. После приема препарата Шиничи теряет сознание.

Придя в себя, Кудо обнаруживает, что его тело уменьшилось до размеров семилетнего ребенка. Чтобы скрыться от преследующих его мафиози, он принимает решение обратиться к Ран. Под новым именем Конан Эдогава он поселяется в доме подруги и знакомится с ее отцом, владельцем детективного агентства.

Сохранив интеллектуальные способности и криминалистические знания, Шиничи продолжает расследовать преступления в своем новом облике. Он помогает в работе детективного агентства, параллельно пытаясь найти способ восстановить первоначальный физический облик и раскрыть деятельность преступной организации.